长期以来，西康藏区盛行宗教教育。藏民送儿童人喇嘛寺当苯觉(俗家弟子)或扎巴(受戒的喇嘛徒弟)，喇嘛寺对苯觉和扎巴进行基础教育，并建立起一套从低到高的教育体系。这种教育模式是近代学校教育在短时间内无法取代的。当政者也认识到藏区的宗教教育仍具有合理成份，从而认可了宗教教育的合法性。因此国民政府对开展僧侣新式教育作出了明确规定，并在重庆创办“汉藏教理院”，在康定筹建“五明学院”，以致在西康学校教育复兴的同时，宗教教育仍得到长足的发展。”

    汉藏教理院由太虚大师于1932创建于重庆，用汉文和藏文研究佛教，帮助政府推广现代化教育。太虚大师得知当时的四川省政府主席、军军长刘湘一直有选派汉人人藏向喇嘛学法，从佛教人手，将西康和西藏纳人自己的势力范围的想法，就建议成立“汉藏教理院”，经四川省政府教育厅批准立案后，汉藏教理院成立。在教学中，一直遵从中央政府的教育政策指导，多次填写国民政府颁发的《全国学术机关概况表》，就汉藏教理院的教学及科研情况呈报政府。“汉藏教理院自成立起就和藏传佛教界保持紧密联系和良好的合作关系，成为沟通汉藏关系的一个重要渠道。一方面，汉藏教理院邀请藏区的一些著名法师格西、活佛到该院任教，将藏传佛教文化介绍到内地，使内地佛教文化界能够了解、研究藏传佛教，并招收康区的藏族学生来院学习，以促进汉藏文化交流。另一方面，汉藏教理院派出学僧去西藏学习。这种互派僧人学习的交流活动，一时间蔚然成风，为日后民族文化的交流和民族感情的增进，奠定了良好基础。”

    1940年7月，教育部公布《改进边疆寺庙教育暂行办法》规定:“边疆各地喇嘛庙或清真寺，应视地方需要及该寺庙经济能力办理下列各事项:1、附设民众教育馆或阅书报室;2、附设小学民众学校或各种补习学校;3、举行通俗讲演，并在讲经后作精神讲话及识字运动;4、举办壁报;5、装设无线电收音机;6、其他切合社会需要之教育。”“礼拜寺附设之阿文学校，每日必须增加国语常识各一小时。”“寺庙办理各种教育具有成绩者，得由当地主管教育行政机关酌予补助，或转呈教育部、蒙藏委员会核准补助之。”