然而，民间信仰与世界三大宗教之间还是存在明显的差异。第一，在组织仪式和教义经典方面，民间信仰并没有规范性、制度化的仪式组织，多为民间群众自发形成，在民间庙宇、集会场所举行活动;而三大宗教都具有制度化、规范化的教会组织和教义思想，基督教以圣经为蓝本，核心思想是福音，教会活动在教堂举行;佛教则以《大藏经》、《金刚经》等为经典，重视人类内心的觉悟与道德修行，具有专门的佛教寺庙活动场所;伊斯兰教以《古兰经》为经典，顺从和信仰创造宇宙的独一无二的主宰安拉及其意志，宗教活动多在清真寺举行。第二，在信仰内涵上，民间信仰崇拜多种神灵，祖先崇拜与巫术崇拜等并行不悖，最高天神为天帝，并且将各种鬼神或者民间人物塑造神像，支持偶像崇拜;而基督教与伊斯兰教则是典型的一神教信仰，分别信奉耶稣和安拉，反对偶像崇拜与多神崇拜;佛教虽是信仰多种神灵，却是最高神佛陀之权化分身而个别崇拜。第三，在信仰目的上，民间信仰则是民众借助鬼神神力以护佑自己，寻求心理安慰或者免除惩罚;基督教则是以人类原罪来进行赎罪，重视内心道德，且上帝不具有免除罪责的权力;佛教则是以修行来发现生命和宇宙的真相，最终超越生死和苦难，去除一切烦恼，得到究极解脱;伊斯兰教则是通过宗教信仰和宗教义务来正确指导人生，并认为信众在世界末日里可以从神灵安拉中获得奖励。第四，在信仰群体方面，民间信仰和宗教都随个人之自由意志接受信仰;但是民间信仰具有地域性特征，受众与地域分布相关;而世界宗教多站立在超越民族、国家立场，信众分布不受地域限制;另外民间信仰在民间广泛存在，属于民间自发形成非规范化组织，而世界三大宗教都有各自的创教始祖人物。